En un libro de 1941 se menciona la construcción de una escuela, por obra e inspiración del Reverendo Padre Fray Alberto Reyes Escobar. Dicha Escuela recibió el Nombre de «Instituto Cristóbal Colón» en honor al ilustre navegante, y su primer Rector fue el Reverendo Padre Pedro José  Herrera, quién abrió Matrículas el 20 de Enero de 1944, con 72 estudiantes franciscanos. En 1945 recibe las riendas del colegio el Reverendo Padre Fray Alberto Reyes Escobar, dejándolo en 1946 en las manos del Reverendo Padre Fray Severo Velásquez, quién a su vez lo vuelve a entregar al Padre Fray Alberto Reyes Escobar.

Para Honrar la Memoria del gran Historiador Franciscano, fundador de la Universidad de Antioquia, Fray Rafael de La Serna, el instituto deja su nombre inicial y toma el del ilustre gestor del Álma Mater de Antioquia por Resolución Ministerial  No. 1610 del 6 de Junio de 1953.

         RECTORES DEL COLEGIO    

Fray Pedro José Herrera 1944	Fray Alberto González Gaviria 1969
Fray Alberto Reyes Escobar 1945	Fray Francisco Tobón Arbeláez 1972
Fray Severo Velásquez Chavarriaga 1946	Fray Jaime Madrigal Zapata 1975
Fray Alberto Reyes Escobar 1953	Fray Adolfo Gartner Giraldo 1978
Fray Severo Velásquez Chavarriaga 1958	Fray Francisco Javier Montoya Sánchez 1984
Fray Luis Eduardo Acosta Betancur 1960	Fray Jaime Daniel Jiménez Paez 1990
Fray Severo Velásquez Chavarriaga 1961	Fray Jorge Luis Portilla Pantoja 1992
Fray Mario Gómez Villegas 1962	Fray Joaquín Arturo Echeverry Hincapié 1996
Fray Bernardo Angel Angel 1966	Fray Carlos Alberto Quintero Vélez 1999
Fray Severo Velásquez Chavarriaga 1967	Fray Jorge Botero Pineda 2002  - 2005

COLEGIO FRANCISCANO FRAY RAFAEL DE LA SERNA
Integrado con la Universidad de San Buenaventura Medellín
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