Desde hace más de 10 años se vienen gestando actividades académicas relacionadas con ciencias básicas, donde se apoya el proceso de docencia e investigación en las facultades. Ahora, con la Resolución de Rectoría 002 del 12 de febrero de 2020, se oficializa la creación y puesta en marcaha del Departamento de Ciencias Básicas y Matemáticas de la Universidad de San Buenaventura Medellín.
El Canciller de la Universidad, Fray Héctor Eduardo Lugo García OFM., Ministro Provincial de la Comunidad Franciscana Provincia de la Santa Fe de Colombia, en uso de sus facultades legales, ha designado a Fray Efrén Parmenio Ortiz Ortiz OFM., y Fray Pierre Guillén Ramírez OFM., para el servicio de Rector General y Secretario General, respectivamente, y en sesión ordinaria del Consejo de Gobierno del 9 de julio de 2019, que se llevó a cabo en la seccional de Cartagena, los presentó oficialmente ante los honorables miembros del Consejo, máximo órgano de orientación y supervisión de la Universidad y primera autoridad académica, administrativa y financiera de la misma.